◼️انتشار شماره اول دوفصل‌نامه علمی-تخصصی رمزیست

در این شماره می‌خوانیم:
-چگونه علوم‌کامپیوتر، زیست‌شناسی را نجات داد
-مارکوف و مارکوف مخفی را بهتر بشناسیم
- دنیای بیوانفورماتیک و پروژه هزار ژنوم!
-کرونا دنیا را تغییر داده، تکنولوژی را چطور؟
- دانشمند قصه‌گو می‌شود
- هر بار ساز و کار طبیعت را فهمیدیم، تغییرش دادند
و‌ ......

📚 دریافت نسخه الکترونیکی نشریه، از طریق اپلیکیشن طاقچه

#نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_بیوانفورماتیک #بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #رمزیست

اینستاگرام رمزیست
@ramzist
@bioinftmu

🎥معرفی شماره اول دوفصل‌نامه علمی-تخصصی رمزیست

📚 دریافت نسخه الکترونیکی نشریه، از طریق اپلیکیشن طاقچه

اینستاگرام رمزیست
در معرفی نشریه، رمزیست را یاری کنید.

#نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک #بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #رمزیست

@ramzist
@bioinftmu

◼️در بخش پیش‌خوان هر شماره قصد داریم برخی اخبار علوم و فناوری‌های مرتبط با بیوانفورماتیک را با هم مرور کنیم.

بیش‌تر از یک سال است که جهان درگیر ویروس کرونا و بیماری ناشی از آن شده است. با وجود تبعات منفی و فاجعه‌بار همه‌گیری، پیشرفت‌های خیره‌کننده‌ای در فناوری‌های مرتبط با علوم زیستی و صنعت واکسیناسیون رخ داده است. در این شماره، به تاثیر ویروس کرونا در پیشرفت تکنولوژی و به طور مشخص نسل جدید توالی‌یابی ژنوم پرداخته و از رویکردهای نوین در ساخت واکسن صحبت خواهیم کرد.

🧩اگر علاقمند به خبرنگاری علمی هستید، در تیم رمزیست از حضور شما استقبال می‌شود.

📚 دریافت نسخه الکترونیکی نشریه، از طریق اپلیکیشن طاقچه

معرفی فصل‌های #نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_بیوانفورماتیک #بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #رمزیست

اینستاگرام رمزیست
@ramzist
@bioinftmu

◼️تاریخ، روایتی از گذشته است. اما چرا بررسی آن برای ما از اهمیت بالایی برخوردار است؟ در پاسخ به این پرسش باید گفت، از جهتی تاریخ مملو از تجارب گذشتگان است، آزمون و خطاهایی که قدم زدن در این مسیر پر پیچ و خم را ممکن می‌کنند؛ مانند روش کار آزمایشگاهی که اگر مطابق آن عمل نشود، آزمایش نتیجه‌ نامعتبر می‌دهد. از سویی دیگر، خواندن تاریخ به ما یادآور می‌شود که ما نیز زمانی جزئی از آن خواهیم شد و آیندگان داستان ما را روایت خواهند کرد.
روایت تاریخ، تلاشی برای تبدیل دنیا به جایی بهتر برای زیستن، شناخت علم و کمک به درک بیشتر فلسفه حیات است.

📚 دریافت نسخه الکترونیکی نشریه، از طریق اپلیکیشن طاقچه

معرفی فصل‌های #نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_بیوانفورماتیک #بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #رمزیست

اینستاگرام رمزیست
@ramzist
@bioinftmu

◼️کانون تخصصی
بیوانفورماتیک، طیف وسیعی از مباحث را در بر می‌گیرد، از بررسی حیوانات و گیاهان گرفته تا مطالعات ژنومیک و پرتئومیک. از طرفی پیشرفت روزافزون نگرش‌ها و روش‌ها، زمینه‌های ظهور مباحث نوین در این حوزه را فراهم می‌کند و پیوسته بر گستردگی این علم می‌‌افزاید. بخش کانون ما را با مباحث تخصصی این رشته آشنا و ابزارها، پایگاه‌های داده، مباحث نوین و تازه‌های این حوزه را معرفی می‌کند.
در این شماره، از نقش بیوانفورماتیک در تعیین توالی ژنوم انسان و ابزار OSPREY جهت مهندسی پروتئین و نقش miRNAها در درمان بیماری کووید۱۹ صحبت می‌کنیم و مروری بر علم نوین زیست‌شناسی مصنوعی خواهیم داشت.


🛑||۵۰٪ تخفیف(تا ۲۳ مرداد)||🛑
📚 دریافت نسخه الکترونیکی نشریه، از طریق اپلیکیشن طاقچه


معرفی فصل‌های #نشریه_رمزیست #بیوانفورماتیک #رمزیست
#انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس

اینستاگرام رمزیست
@ramzist
@bioinftmu

◼️درباب علم- جستارها و مقالات
وقتی سخن از علم به میان می‌آید، توجه‌ها سمت علومی چون ریاضیات، فیزیک و شیمی جلب می‌شود. اما این تنها یک بعد از علم است. جدای از کاربردهای علم در زندگی روزمره مانند فناوری، پزشکی و کشاورزی، ابعاد دیگری نیز برای علم وجود دارد که مورد توجه همه است. برای مثال مباحث مربوط به فلسفه علم و روش‌های علمی که پای فیلسوفان را به این حوزه باز می‌کند و رابطه اخلاق، جامعه و سیاست با علم که توسط اندیشمندان این حوزه‌ها مطالعه می‌شود. از طرف دیگر نحوه تعامل میان مردم عادی و علم نیز از دیگر مباحث نیازمند توجه است.
در این بخش چنین موضوعاتی مورد مطالعه قرار گرفته است؛ از روایت‌گری علمی و رابطه میان علم و جامعه گرفته تا نقش سیاست در علم و بررسی مثال آشنای همه‌گیری کووید۱۹ و در انتها به موضوع نظریه‌های منسوخ‌شده در تاریخ علم پرداخته می‌شود.

🛑||۵۰٪ تخفیف(تا ۲۳ مرداد)||🛑
📚 دریافت نسخه الکترونیکی نشریه، از طریق اپلیکیشن طاقچه

معرفی فصل‌های #نشریه_رمزیست #بیوانفورماتیک #رمزیست
#انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس

اینستاگرام رمزیست
@ramzist
@bioinftmu

◼️ ذره‌بین علوم‌ پایه
درخت دانش که بر ریشه‌های ریاضیات استوار است با فیزیک، شیمی و زیست‌شناسی رشد می‌کند، شاخ و برگ می‌گیرد و علوم دیگر محض و کاربردی را می‌سازد. به همین دلیل قبل از ورود به هر رشته‌ای آشنایی با علوم پایه اهمیت دارد. موضوع میان‌رشته‌ای مانند بیوانفورماتیک از این قاعده مستثنی نیست. عمیق شدن در این رشته نیازمند آشنایی با مفاهیم پایه‌ای از ریاضیات، آمار، شیمی، زیست‌شناسی و علوم کامپیوتر است.
با توجه به این نیاز، در بخش ذره‌بین این مفاهیم پایه‌ بررسی می‌شود. در این شماره از کاربردهای مدل‌های احتمالی مارکوف و مارکوف مخفی در زیست‌شناسی و مروری بر شبکه‌های زیستی صحبت خواهد شد.

🛑||۵۰٪ تخفیف(تا ۲۳ مرداد)||🛑
📚 دریافت نسخه الکترونیکی نشریه، از طریق اپلیکیشن طاقچه

معرفی فصل‌های #نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک #بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #رمزیست

اینستاگرام رمزیست
@ramzist
@bioinftmu

📣کسب رتبه در بخش مقالات تخصصی علوم انسانی

✅ مقاله 《هر بار سازوکار طبیعت را فهمیدیم تغییرش دادند》، به قلم آقای امیر ضرغامی و خانم سارا فیاض زاده در بخش مقالات تخصصی علوم انسانی #رتبه_سوم جشنواره تیتر ۱۲ را به خود اختصاص داد.

برای خواندن این مقاله در نشریه رمزیست به شماره یکم، فصل 《در باب علم》 مراجعه کنید.

📚 دریافت نسخه الکترونیکی نشریه، از طریق اپلیکیشن طاقچه

#نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک #بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #رمزیست #در_باب_علم #تیتر_۱۲

اینستاگرام رمزیست

@ramzist
@bioinftmu

📣رمزیست، برترین نشریه دانشجویی علوم پایه

✅نشریه #رمزیست در بخش نشریات علمی تخصصی علوم پایه به مدیرمسئولی خانم مریم رفیعی پور #رتبه_اول جشنواره تیتر ۱۲ را به خود اختصاص داد.

📚 دریافت نسخه الکترونیکی نشریه، از طریق اپلیکیشن طاقچه

#نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک #بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #رمزیست #علوم_پایه #تیتر_۱۲

اینستاگرام رمزیست

@ramzist
@bioinftmu

با مدل مارکوف و مارکوف مخفی تا چه حد آشنا هستید؟

ایده پشت مدل مارکوف از حقیقتی ذاتی و عمیق بهره می برد که در این جمله خلاصه می شود: "آینده، با وجود زمان حال، مستقل از گذشته است."
اینکه چرا از این مدل احتمالی برای نوشتن توالی زیستی استفاده می کنیم دلایل قانع کننده ای دارد. با دانستن این که داده های زیستی دارای خطای پیش بینی بالا هستند، با تبدیل آن ها به مدل احتمال آماری راه برای استفاده از ابزارهای مختلف باز می شود.

برای دریافت متن کامل به قلم سایه عمادی، شماره اول رمزیست را از اپلیکیشن طاقچه دریافت کنید.

اینستاگرام رمزیست

#رمزیست #نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک
#بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #علوم_پایه #معرفی_مطالب_رمزیست

@ramzist

کرونا دنیا را تغییر داده، تکنولوژی را چطور؟

تست های ژنتیکی برای دنبال کردن رد انتقال ویروس در مواردی که تماس های اپیدمیولوژیک ناشناخته وجود دارد، بسیار حیاتی است. با ایجاد تاریخچه تکاملی ویروس یا درخت خانوادگی آن ها، می توانیم رفتارهایی که منجر به شیوع ویروس می شود را بشناسیم و در نتیجه شیوع های بسیار گسترده را شناسایی کنیم.
روش های توالی یابی استاندارد در حال حاضر قطعاتی کوتاه از توالی، عموماً بین 100 تا 150 حرف ژنتیکی را در یک زمان توالی یابی می کنند در حالی که فن آوری های توالی یابی مبتنی بر Nanopore محدودیتی برای طول قطعات ندارند و می توانند با سرعت بیشتری توالی یک ژنوم را بررسی کنند.

برای دریافت متن کامل به قلم کریم رحیمیان، شماره اول رمزیست را از اپلیکیشن طاقچه دریافت کنید.

اینستاگرام رمزیست

#رمزیست #نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک
#بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #علوم_پایه #معرفی_مطالب_رمزیست
#توالی_یابی #Nanopore

@ramzist

چگونه پوپولیسم بی اعتمادی به علم را گسترش می دهد

با وجود اینکه نخبگان علمی "دانش واقعی" را تولید می کنند، از نظر پوپولیسم این واقعیات دست نیافتنی، زودگذر، مورد مناقشه و جدا از زندگی روزمره مردم عادی هستند.نخبگان علمی به دلیل پاسخ های متمایزشان و استفاده از روش های مصنوعی چون آزمایشات، از نظر پوپولیسم در ارائه راه حل های ساده مورد مطالبه مردم ناتوان اند.
این بی اعتنایی نسبت به مردم عادی و خواسته هایشان، پوپولیسم را بر آن داشته است که نخبگان علمی را به دلیل استفاده از روش های شناختی مصنوعی به جای روش های ساده، طبیعت گرایانه و قابل اعتماد عموم، جمعی غیر اخلاقی توصیف کند.

برای دریافت متن کامل به قلم سحر برهانی، شماره اول رمزیست را از اپلیکیشن طاقچه دریافت کنید.

اینستاگرام رمزیست

#رمزیست #نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک
#بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #علوم_پایه #معرفی_مطالب_رمزیست
#در_باب_علم #پوپولیسم

@ramzist

پروژه هزار ژنوم

هدف اولیه این پروژه تعیین توالی ژنوم انسان به واسطه حداقل 1000 فرد شرکت کننده از تمامی قاره ها بود.
این پروژه دریچه جدید و بزرگی به دنیای بیوانفورماتیک، پزشکی، ژنتیک، داروسازی و بیوشیمی گشود.
تعیین توالی ژنوم انسان به منظور کشف ارتباط میان واریانت های ژنی موجود در ژنوم انسان، بیماری های ژنتیکی و تعیین درمان های هدفمند برای بیماری ها اهمیت زیادی دارد. همچنین اطلاعات حاصل از مطالعه و بررسی این پروژه به منظور تعیین علل بیماری های ژنتیکی برای مطالعه ژنتیک جمعیت ها، تاریخ تکاملی یک جمعیت و پیشرفت روز افزون حوزه پزشکی شخصی محور اهمیت بسیار زیادی دارد.

برای دریافت متن کامل به قلم ریحانه علیدوستی، شماره اول رمزیست را از اپلیکیشن طاقچه دریافت کنید.

اینستاگرام رمزیست

#رمزیست #نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک
#بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #علوم_پایه #معرفی_مطالب_رمزیست
#هزار_ژنوم #پروژه_هزار_ژنوم
#1KGP #dbSNP

@ramzist

شبکه‌های زیستی، ساختارهایی برای درک سلول

عملکرد سلول تنها به یک مولکول مربوط نیست و اکثر ویژگی‌های زیستی حاصل تعاملات پیچیده بین اجزای مختلف سلول است.
توسعه تکنیک‌های جمع آوری داده با کیفیت بالا، امکان تشخیص چگونگی و زمان تعامل اجزای مختلف سلول‌ها با یکدیگر را فراهم کرده است؛ به طوری که می‌توان انواع مختلفی از شبکه‌ها را از آن استخراج کرد. هیچ یک از این شبکه‌ها مستقل نیستند و شبکه‌ای از شبکه‌ها را تشکیل می‌دهند که رفتار سلول را مشخص می‌کند.

برای دریافت متن کامل به قلم مریم رفیعی‌پور، شماره اول رمزیست را از اپلیکیشن طاقچه دریافت کنید.

اینستاگرام رمزیست

#رمزیست #نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک
#بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #علوم_پایه #معرفی_مطالب_رمزیست
#شبکه_های_زیستی


@ramzist

بیوانفورماتیک، از چیستی تا اهمیت

دکتر سید شهریار عرب پس از پذیرش در اولین دوره دکتری بیوانفورماتیک دانشگاه تهران، سال 1388 از دانشگاه فارغ التحصیل شد. از سال 1390 تا کنون ایشان به عنوان عضو هیئت علمی گروه بیوفیزیک دانشگاه تربیت مدرس مشغول به کار هستند. در اولین شماره از مجله رمزیست گفتگویی با ایشان ترتیب داده شد که در آن به معرفی و اهمیت این رشته پرداخته شده است.

برای دریافت متن کامل به قلم فاطمه فضلعلی، شماره اول رمزیست را از اپلیکیشن طاقچه دریافت کنید.

اینستاگرام رمزیست

#رمزیست #نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک
#بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #علوم_پایه #معرفی_مطالب_رمزیست
#مصاحبه #بیوفیزیک #بیوانفورماتیک_چیست


@ramzist

توانایی miRNAها در کنترل ویروس کرونا
‏
پژوهش انجام شده برای اولین بار تاکید بر استفاده از درمان های مبتنی بر miRNAها در مبارزه با ویروس SARS-COV-2 و بیماری های مرگبار از این قبیل دارد. miRNAها با طول متوسط 22 نوکلئوتید نقش اصلی را در تنظیم فرایندهای حیاتی سلول از قبیل رشد، تمایز و آپوپتوز ایفا می کنند. در تحقیقات انجام شده مشخص شده است که کاهش تنظیم بیان miRNA ها به طور قابل توجهی در توسعه و پیشرفت بسیاری از بیماری ها، به ویژه سرطان، دیابت، بیماری های سیستم ایمنی و بیماری های دستگاه عصبی نقش داشته است.

برای دریافت متن کامل به قلم فاطمه محمدی، شماره اول رمزیست را از اپلیکیشن طاقچه دریافت کنید.

اینستاگرام رمزیست

#رمزیست #نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک #بیوفیزیک
#بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #علوم_پایه #معرفی_مطالب_رمزیست
#miRNA #ACE2

@ramzist

دانشمند قصه‌گو می‌شود

ارتباط‌گران علم موظف‌اند با مردم از اتفاقاتی که در حوزه‌های مختلف علمی می‌‌افتد صحبت کنند. هر متخصصی می‌تواند با افراد جامعه چه به صورت مستقیم بی‌واسطه و یا غیرمستقیم و با واسطه در ارتباط باشد. ارتباط‌گری علم از جهات مختلفی اهمیت دارد. از جمله این که ارتباط‌گری علم باعث افزایش اعتماد عمومی در جامعه می‌شود. در واقع ارتباط‌گری علم فرصت گفت‌وگو بین مردم جامعه را به خوبی فراهم می‌کند و در فضایی که امکان گفت‌و‌گوی آزادانه وجود دارد، رشد شایعات و اطلاعات غلط کمتر می‌شود.

برای دریافت متن کامل به قلم سعیده زارع، شماره اول رمزیست را از اپلیکیشن طاقچه دریافت کنید.

اینستاگرام رمزیست

#رمزیست #نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک #بیوفیزیک
#بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #علوم_پایه #معرفی_مطالب_رمزیست
#بهترین_قصه_گو_برنده_است #روایتگری_در_علم

@ramzist

زیست‌شناسی مصنوعی

کم‌کم همۀ زیست‌شناسان دریافتند که بین مهندسی و زیست‌شناسی ویژگی‌های مشترک زیادی هست. در دانش مهندسی وقتی یک بخش از سیستم طراحی، مهندسی و ساخته می‌شود؛ سازنده می تواند با ارزیابی عملکرد و تاثیر آن بر کل سیستم، دلیلی بر وجود آن بخش ارائه دهد. حالا به طبیعت نگاه کنید. تمام سیستم‌های طبیعی که می‌بینید بخشی از یک کل واحد هستند که "وجود" دارند و "عملکرد مشخص" دارند. بنابراین ارزیابی عملکردها، این‌جا نیز باید پاسخ‌گو باشد و بتواند علت هر رفتار زیستی را توضیح دهد.

برای دریافت متن کامل به قلم عطیه احمدی، شماره اول رمزیست را از اپلیکیشن طاقچه دریافت کنید.

اینستاگرام رمزیست

#رمزیست #نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک #بیوفیزیک
#بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #علوم_پایه #معرفی_مطالب_رمزیست
#زیست_شناسی #زیست_شناسی_مصنوعی

@ramzist